Populasyon Genomiği: Temel Kavramlar, Veri Bankaları ve Veri Analizleri Uygulamalı Eğitimi

EĞİTİMCİLER: Dr. Evren KOBAN BAŞTANLAR, Dr. Soner AKSU, Melis DENİZCİ

EĞİTİM TARİHİ: 03-07 Haziran 2013

SON BAŞVURU TARİHİ: 10 Mayıs 2013

AMAÇ

Biyoloji, Tıp, Veterinerlik ve Ziraat alanlarında oldukça yaygın uygulamaları olan populasyon genetiği çalışmalarında projenin amaçlarına uygun kapsamı belirlerken ve kullanılacak DNA işaretlerini seçerken göz önünde tutulacak önemli noktalar vurgulanarak katılımcıların konudaki yetkinliklerine katkıda bulunmak hedeflenmektedir. Ayrıca, eğitim dahilinde, populasyon genetiği çalışmalarında farklı tipteki DNA işaretlerinden elde edilen verilerin analizi için kullanılan ve literatürde en çok tercih edilen yazılımlar hakkında bilgi verilecek, örnek veri setleri ya da katılımcıların kendi veri setleri uygulamalı olarak analiz edilecektir.

İÇERİK

1. Populasyon genetiği çalışmalarında deney dizaynı
2. Deney dizaynı ve veri analizinde önemli kavramlar: bağlantı, seçim, mutasyon ve seçim dengesi, Hardy-Weinberg eşitliği ve bağlantı eşitsizliği
3. Veri bankalarından yararlanma
4. Farklı DNA işaretleri ve kullanım alanları (RFLP, AFLP, RAPD, mikrosatelit, SNP, dizi analizi)
5. Farklı DNA işaretlerinden elde edilen bu verilerin analizinde kullanılan temel programlar
6. Programlara ve veri tipine uygun analiz dosyası hazırlamak
7. Verilerin uygulamalı analiz edilmesi
8. Bağlantı eşitsizliğinin uygulama alanları

UYGULAMALAR

Eğitimde kullanılacak programlar katılımcılara önceden sağlanacaktır. Ayrıca eğitim sırasında her katılımcının internet bağlantısı olacaktır. Dersler interaktif şekilde uygulamalı olarak gerçekleştirilecektir. Daha sonra örnek veri setleri ya da katılımcıların kendi veri setleri ile alıştırmalar yapılacaktır. Uygulama konuları:

1. Veri bankalarına erişim ve veri toplama
2. Verilerin analiz dosyalarını hazırlamak: internet üzerinden erişilen biyoinformatik araçlar ve hazır yazılımlar kullanarak
3. Analiz programlarının interaktif olarak örnek veri dosyası ile kullanılması
4. Örnek veri setleri ya da katılımcıların kendi veri setlerini kullanılarak öğrenilen programlarla alıştırma analizleri gerçekleştirmek ve sonuçların yorumlanması.

MAKSİMUM KATILIMCI SAYISI: 10 Kişi

KATILIMCI PROFİLİ

Biyolojik Bilimler, Sağlık Bilimleri, Tıp, Veteriner ve Ziraat Fakültelerinin ilgili ana bilim dallarındaki lisansüstü programlarında öğrenim gören öğrenciler, Bakanlıklar, kamu AR-GE kuruluşları ve özel sektörde çalışan ilgili kişiler eğitime katılabilirler

Eğitime kabul edilen katılımcıların, kendi dizüstü bilgisayarlarını getirmeleri gerekmektedir.

EĞİTİM ÜCRETİ

Eğitim ücretlerinin yatırılması hakkında detaylı bilgi, eğitime kabul edilen katılımcılara iletilecektir.

KONAKLAMA VE DİĞER BİLGİLER

Günlük misafirhane konaklama ücreti

* Fiyatlar bir ay öncesinden kesinleşecektir.

Eğitim dili Türkçedir. Katılımcılar eğitimin düzenleneceği TÜBİTAK MAM GMBE ile İstanbul, İzmit ve Gebze'ye gidiş dönüşlerde kurum servislerinden ücretsiz olarak yararlanabileceklerdir. Eğitime katılmak isteyen adayların son başvuru tarihinden önce aşağıdaki başvuru çizelgesini doldurarak zehra.peksen@mam.gov.tr adresine iletmeleri gerekmektedir. Eğitim ücretlerinin yatırılması hakkında detaylı bilgi, eğitime kabul edilen katılımcılara iletilecektir.

 BAŞVURU ÇİZELGESİ 

Yazışma Adresi:  : Dr. Evren KOBAN BAŞTANLAR
TÜBİTAK Gebze Yerleşkesi
Gen Mühendisliği ve Biyoteknoloji Enstitüsü
P.K. 21 41470 Gebze-KOCAELİ
Tel: 0262 677 33 69
Faks: 0262 641 23 09
E-mail: evren.koban@tubitak.gov.tr