Genetik Çalışmalarda Biyoinformatik Uygulamalar:

 

Geri Dön

 

EĞİTİMCİLER: Dr. Soner Aksu, Dr. Diğdem Aktopraklıgil Aksu, Dr. Evren Koban

EĞİTİM TARİHİ:13-17 Mayıs 2013

SON BAŞVURU TARİHİ: 05 Nisan 2013 

AMAÇ

Planlanan konu içeriğine paralel olarak bu eğitimin iki temel amacı bulunmaktadır. İlk olarak, genetik çalışmalarda araştırmacıların sıklıkla ihtiyaç duydukları verilerin elde edilmesini sağlayan belli başlı genom veri bankalarının ve biyoinformatik araçların tanıtılması, uygulamalı çalışmalarla söz konusu veri bankalarından ve araçlardan nasıl ve ne şekilde yararlanılabileceğinin katılımcılara aktarılması amaçlanmaktadır. İkinci amaç ise, deneysel çalışmalarla elde edilen DNA dizilerinin analiz edilmesinde kullanılan temel DNA dizi analiz programları hakkında bilgi vermek ve kullanımlarını göstermektir. Böylelikle verilecek olan bu eğitim ile katılımcılara hem genom veri bankaları hem de DNA dizi analiz yöntemleri açısından yetkinlik kazandırılması hedeflenmektedir.

İÇERİK

  • Genom veri bankalarına erişim ve kullanım
  • Metabolik yolak ve gen fonksiyonu veri bankalarına erişim ve kullanım
  • İnternet üzerinden erişilebilen biyoinformatik araçlar ve kullanımları: DNA dizi dönüştürücüler, primer tasarımı, DNA dizilerini hizalama (alignment) ve dizi benzerliklerini belirleme
  • Gen promotor bölgelerinin tespiti ve analizi
  • Temel DNA dizi analizi programları: Bioedit, MEGA, DnaSP, Arlequin, Network, TreeView

UYGULAMALAR

Her katılımcıya internet bağlantısı sağlanacak ve gösterilecek programlar önceden katılımcıların kişisel bilgisayarlarına yüklenecektir. Böylelikle tüm derslerin uygulamalı olarak gerçekleştirilmesi sağlanacaktır. Katılımcılar, anlatım sırasında dahi her işlemi bire bir uygulayacak ve anlatım sonrası ek alıştırma yapılacaktır. Bu bağlamda her katılımcı aşağıda belirtilen uygulamaları gerçekleştirecektir:

  • Eğitim kapsamında anlatılan genom veri bankalarını kullanarak herhangi bir genomik bölge ya da gen hakkında farklı tipte verilerin toplanması ve farklı veri bankalarından toplanan benzer bilgilerin karşılaştırılarak doğrulanması,
  • İnternet üzerinden erişilebilen biyoinformatik araçları kullanarak DNA dizilerinin hizalanması ve karşılaştırılması,  primer tasarlanması ve DNA dizilerinin farklı formatlara çevrilmesi,
  • Gösterilen DNA dizi analiz programlarını kullanarak verilen DNA dizi örneklerinin analizlerinin gerçekleştirilmesi ve sonuçların yorumlanması

MAKSİMUM KATILIMCI SAYISI: 10 Kişi

KATILIMCI PROFİLİ

Biyolojik Bilimler, Sağlık Bilimleri, Tıp, Veteriner ve Ziraat Fakültelerinin ilgili ana bilim dallarındaki lisansüstü programlarında öğrenim gören öğrenciler, Bakanlıklar, kamu AR-GE kuruluşları ve özel sektörde çalışan ilgili kişiler eğitime katılabilirler.

Eğitime kabul edilen katılımcıların, kendi dizüstü bilgisayarlarını getirmeleri gerekmektedir.
 

EĞİTİM ÜCRETİ

Katılımcı Türü

Eğitim  Ücreti  TL (%18 KDV dahil)

Öğrenci ve Araştırma Görevlileri

600

Öğretim Üyesi/Diğer Kamu Çalışanları

700

Özel Sektör Çalışanları

1000

Eğitim ücretlerinin yatırılması hakkında detaylı bilgi, eğitime kabul edilen katılımcılara iletilecektir.

KONAKLAMA VE DİĞER BİLGİLER

Günlük misafirhane konaklama ücreti

 

Üniversite ve kamu kurum/kuruluş personeli:

 

30 TL (KDV dâhil, kişi başı kalış)

Kahvaltı:

Yemek:

 6 TL (KDV dâhil)

11 TL (KDV dâhil)

* Fiyatlar bir ay öncesinden kesinleşecektir.

Eğitim dili Türkçedir. Katılımcılar eğitimin düzenleneceği TÜBİTAK MAM GMBE ile İstanbul, İzmit ve Gebze'ye gidiş dönüşlerde kurum servislerinden ücretsiz olarak yararlanabileceklerdir. Eğitime katılmak isteyen adayların son başvuru tarihinden önce aşağıdaki başvuru çizelgesini doldurarak zehra.peksen@tubitak.gov.tr adresine iletmeleri gerekmektedir. Genel olarak kurs kontenjanının üzerinde başvuru olmaktadır ve kursiyerler başvuru formunda beyan edilen bilgiler doğrultusunda seçilmektedir. Bu nedenle başvuru formundaki tüm bilgilerin eksiksiz ve özenle doldurulması önemle rica olunur. Başvuru süresini takiben olumlu yada olumsuz tüm başvuru sahiplerine e-mail ile bilgi verilecektir. Eğitim ücretlerinin yatırılması hakkında detaylı bilgiyse eğitime kabul edilen katılımcılara ayrıca iletilecektir.
 

BAŞVURU ÇİZELGESİ

Yazışma Adresi:  Dr. Soner AKSU
TÜBİTAK Gebze Yerleşkesi
Gen Mühendisliği ve Biyoteknoloji Enstitüsü
P.K. 21 41470 Gebze-KOCAELİ
Tel: 0262 677 33 68
Faks: 0262 641 23 09
E-mail: soner.aksu@tubitak.gov.tr

 

-A +A